• صفحه اصلی
  • مرور
    • شماره جاری
    • بر اساس شماره‌های نشریه
    • بر اساس نویسندگان
    • بر اساس موضوعات
    • نمایه نویسندگان
    • نمایه کلیدواژه ها
  • اطلاعات نشریه
    • درباره نشریه
    • اهداف و چشم انداز
    • اعضای هیات تحریریه
    • اعضای مشورتی هیات تحریریه
    • همکاران دفتر نشریه
    • اصول اخلاقی انتشار مقاله
    • بانک ها و نمایه نامه ها
    • پیوندهای مفید
    • پرسش‌های متداول
    • فرایند پذیرش مقالات
    • اخبار و اعلانات
  • راهنمای نویسندگان
  • ارسال مقاله
  • داوران
  • تماس با ما
 
  • ورود به سامانه ▼
    • ورود به سامانه
    • ثبت نام در سامانه
  • English
صفحه اصلی فهرست مقالات مشخصات مقاله
  • ذخیره رکوردها
  • |
  • نسخه قابل چاپ
  • |
  • توصیه به دوستان
  • |
  • ارجاع به این مقاله ارجاع به مقاله
    RIS EndNote BibTeX APA MLA Harvard Vancouver
  • |
  • اشتراک گذاری اشتراک گذاری
    CiteULike Mendeley Facebook Google LinkedIn Twitter Telegram
مجله علمی - پژوهشی دانشگاه علوم پزشکی سبزوار
مقالات آماده انتشار
شماره جاری
شماره‌های پیشین نشریه
دوره دوره 26 (1398)
شماره شماره 4
شماره شماره 3
شماره شماره 2
شماره شماره 1
دوره دوره 25 (1397)
دوره دوره 24 (1396)
دوره دوره 23 (1395)
دوره دوره 22 (1394)
دوره دوره 21 (1393)
دوره دوره 20 (1392)
دوره دوره 19 (1391)
دوره دوره 18 (1390)
دوره دوره 17 (1389)
دوره دوره 16 (1388)
دوره دوره 15 (1387)
دوره دوره 14 (1386)
دوره دوره 13 (1385)
دوره دوره 12 (1384)
دوره دوره 11 (1383)
هادی چگنی, امیر, هادی, فرانک, کوثری, مژگان, زارع, مریم, غلامی محمدی, عبدالناصر. (1398). بررسی فعالیت ضد قارچی باکتری های بومی جدا شده از خاک کشاورزی خرم آباد. مجله علمی - پژوهشی دانشگاه علوم پزشکی سبزوار, 26(3), 383-391.
امیر هادی چگنی; فرانک هادی; مژگان کوثری; مریم زارع; عبدالناصر غلامی محمدی. "بررسی فعالیت ضد قارچی باکتری های بومی جدا شده از خاک کشاورزی خرم آباد". مجله علمی - پژوهشی دانشگاه علوم پزشکی سبزوار, 26, 3, 1398, 383-391.
هادی چگنی, امیر, هادی, فرانک, کوثری, مژگان, زارع, مریم, غلامی محمدی, عبدالناصر. (1398). 'بررسی فعالیت ضد قارچی باکتری های بومی جدا شده از خاک کشاورزی خرم آباد', مجله علمی - پژوهشی دانشگاه علوم پزشکی سبزوار, 26(3), pp. 383-391.
هادی چگنی, امیر, هادی, فرانک, کوثری, مژگان, زارع, مریم, غلامی محمدی, عبدالناصر. بررسی فعالیت ضد قارچی باکتری های بومی جدا شده از خاک کشاورزی خرم آباد. مجله علمی - پژوهشی دانشگاه علوم پزشکی سبزوار, 1398; 26(3): 383-391.

بررسی فعالیت ضد قارچی باکتری های بومی جدا شده از خاک کشاورزی خرم آباد

مقاله 13، دوره 26، شماره 3، مرداد و شهریور 1398، صفحه 383-391  XML اصل مقاله (814 K)
نوع مقاله: مقاله پژوهشی
نویسندگان
امیر هادی چگنیorcid 1؛ فرانک هادی orcid 2؛ مژگان کوثری3؛ مریم زارع4؛ عبدالناصر غلامی محمدی5
1گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه؛ دانشگاه آزاد اسلامی واحد بروجرد، ایران
2گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه، دانشگاه علوم، دانشگاه لرستان، خرم آباد، ایران
3پژوهشکده بیوتکنولوژی کشاورزی، کرج، ایران
4گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه؛ دانشگاه پیام نور، تهران، ایران
5گروه زیست شناسی، دانشکده علوم پایه؛ دانشگاه لرستان، ایران
تاریخ دریافت: 06 فروردین 1397،  تاریخ بازنگری: 22 مهر 1397،  تاریخ پذیرش: 30 شهریور 1398 
چکیده
زمینه و هدف: ظهور گونه‌های مقاوم به داروها و همچنین محدودیت استفاده از داروهای ضد قارچی به دلیل اثرات سمی احتمالی در انسان، هزینه بالای تولید آن‌ها و آلودگی محیط‌زیست ناشی از مصرف این داروها تحقیقات موردنیاز برای یافتن ترکیبات ضد قارچی جدید را ضروری دانسته است. میکروارگانیسم‌ها به‌ویژه باکتری‌های خاک طیف گسترده‌ای از مواد ضد میکروبی و فعال را تولید می‌کنند که برخی از آن‌ها خاصیت ضد قارچی دارند. هدف از این مطالعه جداسازی باکتری‌های مؤثر بر رشد قارچ‌ها، از خاک کشاورزی شهرستان خرم‌آباد است.
مواد و روش‌ها: نمونه‌برداری از خاک کشاورزی مناطق مختلف شهرستان انجام شد. سپس جداسازی باکتری‌های خاک با استفاده از محیط نوترینت براث و نوترینت آگار انجام و به دنبال آن اثر ضد قارچی مایع رویی و همچنین عصاره آن‌ها به روش انتشار دیسک در محیط SCA بر روی چندین گونه قارچ مورد بررسی قرار گرفت.
یافته‌ها: در کل چهار جدایه، دارای اثرات ضد قارچی قابل‌ملاحظه‌ای بر روی برخی قارچ‌ها شامل Aspergillus niger،Aspergillus flavus،Aspergillus fumigatus و Candida albicans بودند. این جدایه‌ها با استفاده از آزمون‌های بیوشیمیایی و تعیین توالی ژن SrRNA16 شناسایی شدند. پس از جستجوی توالی آن‌ها از طریق BLAST در بانک اطلاعاتی NCBI جنس باکتری‌ها متعلق به دو جنس Pseudomonas و Acinetobacter بودند.
نتیجه‌گیری: این اولین گزارش از بررسی فعالیت ضد قارچی، باکتری‌های جداشده از خاک کشاورزی خرم‌آباد است. این باکتری‌ها می‌توانند کاندید مناسبی برای کنترل زیستی قارچ‌های بیماری‌زا باشند. استخراج، شناسایی و به‌کارگیری متابولیت‌های مهاری آن‌ها می‌تواند در طراحی و تولید داروهای ضد قارچی استفاده شود.
کلیدواژه‌ها
جداسازی باکتری؛ ضد قارچ؛ روش انتشار دیسک؛ S rRNA16
موضوعات
میکروبیولوژی، ویروس، قارچ و انگل
عنوان مقاله [English]
Antifungal activity of native bacteria isolated from Khorramabad agricultural soil
نویسندگان [English]
Amir Hadi Chegeni1؛ Faranak Hadi2؛ Mojgan kowsari33؛ Maryam Zare4؛ Abdolnaser Gholami Mohammadi5
1Department of Biology, Faculty of science, Azad University, Brojerd, Iran
2Biology department, Faculty of science, Lorestan university, Khorramabad, Iran
3Agricultural Biotechnology Research Institute of Iran, Karaj, Iran
4Department of Biology, Faculty of Science, Payamme Noor University, Tehran, Iran
5Department of Biology, Faculty of Science, Lorestan University, Khorramabad, Iran
چکیده [English]
Background: Emergence of drug resistant strains and the limited use of antifungal drug due to possible toxic effects on humans, the high cost of their production and environmental pollution has made the search for novel bio-antifungal compounds a necessity. Microorganisms, particularly soil bacteria produce a wide range of active antimicrobial substances that some of them have antifungal properties. The purpose of this study is isolation and identification of the bacteria affecting the growth of fungi from Khorramabad agricultural soil.
Materials and Methods: Agricultural soils were collected from different areas of Khorramabad, Lorestan Province. The bacteria were isolated using nutrient broth and nutrient agar, then, the antifungal activity of their extracts and supernatant in the SCA media on several species of fungi was studied applying disk diffusion method.
Results: Four strains showing a remarkable antifungal effect against some fungi, including Aspergillus niger, Aspergillus flavus, Aspergillus fumigatus and Candida albicans. These isolates were identified by biochemical features and 16S rRNA sequence. Analysis of their sequencing through BLAST in NCBI data bank showed that these bacterial similarly closed to Pseudomonas sp. and Acinetobacter sp. genus.
Conclusion: This study was the first report of antifungal analysis of soil isolated bacteria from Khorramabad. These bacteria could be a potential candidate for biocontrolling pathogenic fungi.The extraction, identification and development of their inhibitory metabolites can be used in the design and production of antifungal agents.
کلیدواژه‌ها [English]
Bacterial isolation, Antifungal, Disk diffusion method, 16SrRNA
مراجع

 

1.Oueslati S, Romero-Gonzalez R, Lasram S, Frenich AG, Vidal JLM. Multi-mycotoxin determination in cereals and derived products marketed in Tunisia using ultrahigh performance liquid chromatography coupled to triple quadrupole mass spectrometry. Food and Chemical Toxicology. 2012; 50(7):2376-81.

2.Ranjbariyan AR, Shams-Ghahfarokhi M, Kalantari S, Razzaghi-Abyaneh M. Molecular identification of antagonistic bacteria from Tehran soils and evaluation of their inhibitory activities toward pathogenic fungi. Iranian Journal of Microbiology. 2011;3(3):140-146

3.Ji C, Fan Y, Zhao L. Review on biological degradation of mycotoxins. Animal Nutrition. 2016; 2(3): 127-133

4.Frey-Klett P, Burlinson P, Deveau A, Barret M, Tarkka M, Sarniguet A. Bacterial-fungal interactions: hyphens between agricultural, clinical, environmental, and food microbiologists. Micobiology and Molecular Biology Reviews. 2011; 75(4): 583-609.

5.Teniola OD,Addo PA, Brost IM, Färber P, Jany KD, Alberts JF, van Zyl WH, Steyn PS, Holzapfel WH. Degradation of aflatoxin B(1) by cell-free extracts of Rhodococcuserythropolis and Mycobacterium fluoranthenivorans sp. nov.DSM44556(T). International Journal of Food Microbiology. 2005; 105(2): 111–117

6.Lane DL. 16S/23S rRNA sequencing. In Nucleic Acid Techniques in Bacterial Systematics; Stackenbradt, E., Goodfellow, M., Eds.; John Wiley: New York, 1991.

7.Tamura K, Stecher G, Peterson D, FilipskiA, Kumar S. MEGA6: Molecular Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 6.0. Molecular Biology and Evolution.2013; 30(12):2725–2729.

8.Gohel V, Singh A, Vimal M, Ashwini P, Chhatpar HS. Bioprospecting and antifungal potential of chitinolytic microorganisms.African Journal of Biotechnology. 2006; 5(2), 54-72.

9. Kirk JL, Beaudette LA, Hart M, Moutoglis P, Klironomos JN, Lee H et al. Methods of studying soil microbial diversity. Journal of Microbiological Methods.2004;58(2):169-88.

10.Hashemi S, NasrollahiOmra A, Pordeli H, Hosenian A. Study of Anti-fungal Effects of Isolated streptomycessp. from Gorgan Areas.Medical Laboratory Journal,Golestan University of Medical Sciences. 2010;4(2):7-16

11.Janaki T, Nayak BK, Ganesan T. Antifungal activity of soil actinomycetes from the mangrove Avicennia marina. Journal of Medicinal Plants Studies. 2016;4(2):05-08

12.Stein T. Bacillus subtilisantibiotics: structures, syntheses and specific functions. Molecular Microbiology. 2005;56(4):845-857

13.Kimura N, Hirano S. Inhibitory Strains of Bacillus subtilis for Growth and Aflatoxin. production of Aflatoxigenic Fungi. Agricultural and Biological Chemistry.1988; 52(5):1173-1179.

14.Petchkongkaew A, Taillandier P, Gasaluck P, Lebrihi A. Isolation of Bacillus spp. from Thai fermented soybean (Thua-nao): screening for aflatoxin B1 and ochratoxin A detoxification. Journal of Applied Microbiology. 2008;104:1495-1502

15.Li X, Zhang Y, Wei Z, Guan Z, Cai Y, Liao X. Antifungal Activity of Isolated Bacillus amyloliquefaciens SYBC H47 for the Biocontrol of Peach Gummosis. PLoS ONE. 2016;11(9):e0162125

16-Emmert EA, Handelsman J. Biocontrol of Plant Disease: a (Gram-) Positive Perspective, FEMS Microbiology Letters. 1999;171(1):1-9.

17.Gunasinghe RN, Ikiriwatte CJ, Karunaratne AM. The use of Pantoeaagglomerans and Flavobacterium sp. to control banana pathogens.The Journal of Horticultural Science and Biotechnology. 2004; 79(4): 1002–1006.

18.Mann R, Rehm HJ. products from aflatoxin B1 by Corynebacteriumrubrum, Aspergillusniger, Trichodermavirideand Mucorambiguus.European journal of applied microbiology and biotechnology. 1976; 2(4): 297-306

19.Coallier- Ascah J, Idziak ES. Interaction between Streptococcus lactis and Aspergillusflavus on production of Aflatoxin.Applied and Environmental Microbiology.1995; 49(1):163–167.

20.Gajbhiye MH, KapadnisBP.Antifungal-activity-producing lactic acid bacteria as biocontrol agents in plants. Biocontrol Science and Technology. 2016; 26(11): 1451-1470

21.Muñoz R, Arena ME, Silva J, González SN. Inhibition of mycotoxin-producing Aspergillusnomiusvsc 23 by lactic acid bacteria and Saccharomyces cerevisiae.Brazilian Journal of Microbiology. 2010; 41(4): 1019-26

22.Ghonaimy GA, Yonis AA, Abol-Ela MF. Inhibition of Aspergillusflavus and A. parasiticus fungal growth and its aflatoxins (B1, B2, G1 and G2) production by Lactobacillus acidophilus.Journal of the Egyptian Society of Toxicology. 2007; 37: 53-60

23.Ghazvini RD, Kouhsari E, Zibafar E, Hashemi SJ, Amini A, Niknejad F. Antifungal Activity and Aflatoxin Degradation of BifidobacteriumBifidum and Lactobacillus Fermentum Against Toxigenic AspergillusParasiticus.The Open Microbiology Journal. 2016; 10:197-201

24.Bayankaram PP, Sellamuthu PS.Antifungal and anti-aflatoxigenic effect of probiotics against Aspergillusflavusand Aspergillusparasiticus. Toxin Reviews. 2016; 35(1-2): 10-15

25. Khanafari A, Soudi H, Miraboulfathi M, KarameiOsboo R, An In vitro investigation of Aflatoxin B1 Biological Control by Lactobacillus plantarum.Pakistan Journal of Biological Sciences. 2007; 4(3):163-168.

26. Teniola OD, Addo PA, Brost IM, Farber P, Jany KD, Alberts JF, et al. Degradation of aflatoxin B(1) by cell-free extracts of Rhodococcuserythropolis and Mycobacterium fluoranthenivorans sp. nov.DSM 44556(T).International Journal of Food Microbiology. 2005;105(2):111-117.

27.Moraes APR, Videira SS, Bittencourt VREP, Bittencourt AJ. Antifungal activity ofStenotrophomonasmaltophiliinStomoxyscalcitran larvae.RevistaBrasileira de ParasitologiaVeterinária. 2014; 23: 194–199.

28. Mickler CJ, Bowen KL, Kloepper JW.Evaluation of selected geocarposhpere bacteria for biological control of Aspergillusflavus in peanut.Plant Soil. 1995;175:291–299

29. Leon M, Yaryura PM, Montecchia MS, HernandezAI, CorreaOS,PucheuNL, et al. Antifungal Activity of Selected Indigenous Pseudomonas and Bacillus from the Soybean Rhizosphere. International Journal of Food Microbiology.2009; 2009:572049.

30.Sangare L, Zhao Y, Folly YM, Chang J, Li J, Selvaraj JN, Xing F, Zhou L, Wang Y, Liu Y. Aflatoxin B1 degradation by a Pseudomonas strain. Toxins (Basel). 2014;6(10):3028-40.

31.Mannaa M, Oh JY, Kim KD. Microbe-mediated control of Aspergillusflavus in stored rice grains with a focus on aflatoxin inhibition and biodegradation. Annals of Applied Biology. 2017;171(3):376–392.

32.Mannaa M, Oh JY, Kim KD. Biocontrol activity of volatile-producing Bacillus megateriumand Pseudomonas protegens against Aspergillusflavus and aflatoxin production on stored rice grains.Mycobiology. 2017;45(3):213–219

33.Mannaa M, Kim KD. Biocontrol Activity of Volatile-Producing Bacillus megateriumand Pseudomonas protegensAgainst Aspergillus and Penicilliumspp. Predominant in Stored Rice Grains: Study II.Mycobiology. 2018; 46(1): 52-63

34.Trotel-Aziz P, Couderchet M, Biagianti S, Aziz A. Characterization of new bacterial biocontrol agents Acinetobacter, Bacillus, Pantoea and Pseudomonas spp. mediating grapevine resistance against Botrytis cinerea. Environmental and Experimental Botany. 2008; 64(1):21–32

35.Liu CH, Chen X, Liu TT, Lian B, Gu Y, Caer V, et al. Study of the antifungal activity of Acinetobacterbaumannii LCH001 in vitro and identification of its antifungal components. Applied Microbiology and Biotechnology.2007;76(2):459-66

36.Raaijmakers JM, Vlami M, de Souza JT. Antibiotic production by bacterial biocontrol agents. Antonie Leeuwenhoek. 2002;81(1–4):537–547

37.Ramette A, Frapolli M, Defago G, Moenne-Loccoz Y. Phylogeny of HCN synthase-encoding hcnBC genes in biocontrolfluorescentpseudomonads and its relationship with host plant species and HCN synthesis ability. MolecularPlant-Microbe Interactions Journal. 2003;16(6):525-35

38. yan LL, Li YQ, Wang Y, Zhang XH, Xu YQ. Optimization of critical medium components using response surface methodology for Phenazine-1-carboxylic acid production by Pseudomonas sp. M-18Q.Journal of Bioscience and Bioengineering. 2008;105(3):232-237

آمار
تعداد مشاهده مقاله: 47
تعداد دریافت فایل اصل مقاله: 61
صفحه اصلی | واژه نامه اختصاصی | اخبار و اعلانات | اهداف و چشم انداز | نقشه سایت
ابتدای صفحه ابتدای صفحه

Journal Management System. Designed by sinaweb.